Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BGRP55822 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms