Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms