Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPAP53621 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPAP53621 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPAP53621 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms