Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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