Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQGAP1P46940 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms