Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRATP43155 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRATP43155 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms