Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms