Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms