Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms