Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYKP34925 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYKP34925 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYKP34925 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RYKP34925 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RYKP34925 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms