Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms