Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA7P31268 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms