Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBL1P28749 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RBL1P28749 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBL1P28749 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms