Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4AP27815 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms