Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms