Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFYAP23511 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFYAP23511 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms