Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME2P23368 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME2P23368 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME2P23368 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME2P23368 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME2P23368 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME2P23368 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME2P23368 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ME2P23368 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ME2P23368 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ME2P23368 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ME2P23368 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ME2P23368 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME2P23368 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms