Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF1P22415 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USF1P22415 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF1P22415 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms