Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms