Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms