Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B1P20020 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms