Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A1P19634 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms