Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB3P16520 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB3P16520 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB3P16520 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB3P16520 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB3P16520 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB3P16520 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB3P16520 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB3P16520 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB3P16520 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms