Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms