Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms