Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEFHP12036 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms