Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3P10147 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCL3P10147 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms