Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HKR1P10072 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms