Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG8P0DPA2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms