Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF3P09919 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF3P09919 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms