Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFMP07197 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms