Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms