Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLBP06746 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLBP06746 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLBP06746 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLBP06746 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLBP06746 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLBP06746 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLBP06746 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLBP06746 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLBP06746 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLBP06746 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLBP06746 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLBP06746 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLBP06746 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLBP06746 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLBP06746 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLBP06746 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLBP06746 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLBP06746 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLBP06746 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLBP06746 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLBP06746 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLBP06746 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLBP06746 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLBP06746 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLBP06746 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLBP06746 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms