Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms