Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms