Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms