Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms