Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL13O43927 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms