Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms