Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF1O43189 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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