Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GNPATO15228 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPATO15228 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPATO15228 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPATO15228 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPATO15228 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms