Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBDO15205 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBDO15205 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBDO15205 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBDO15205 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBDO15205 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBDO15205 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBDO15205 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBDO15205 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBDO15205 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBDO15205 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms