Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHOX2AO14813 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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