Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms