Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
WASHC1A8K0Z3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WASHC1A8K0Z3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms