Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms