Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms