Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF316A6NFI3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms