Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PALM3A6NDB9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms