Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms